Ateliers > Biodiversité microbienne des sédiments

Atelier thématique animé par Cécile Militon (MCF AMU)

Résumé : Les mangroves produisent une quantité importante de matières organiques qui, une fois transférées dans les sédiments, les estuaires ou les eaux littorales, sont à la base d’un réseau trophique important principalement contrôlé par les microorganismes. Dans les sédiments, la biomasse microbenthique est principalement composée de bactéries et de fonges qui jouent un rôle prépondérant dans les cycles biogéochimiques de nombreux éléments et notamment du carbone. Leurs activités (e.g. respiration, fermentation, fixation de l’azote, ammonification, nitrification, dénitrification, sulfato-réduction), modulées par celles des autres organismes benthiques, impactent le stockage du carbone ainsi que la disponibilité des nutriments influençant les profils de végétation dans les zones intertidales. Dans l’atelier « Biodiversité microbienne », nous proposons une immersion dans le monde microbien des sédiments de mangrove : de la diversité des acteurs et des processus impliqués dans les cycles biogéochimiques dans une environnement complexe composé de nombreux microhabitats aux interactions biologiques au sein du microbenthos et avec les autres compartiments de l’écosystème mangrove. Enfin, nous proposons d’avoir une réflexion autour des outils culturaux et moléculaires permettant d’accéder à la biodiversité du microbenthos, de sa fraction active, de ses fonctions et donc de comprendre le fonctionnement de ces communautés dans leurs habitats.

Les thèmes traités dans cet atelier seront ajustés et affinés en fonction des participants retenus à l'issue de la clôture des préinscriptions.

Biofilm microphytobenthique colonisant un banc

de vase côtier à marée descendante © C.Proisy IRD